细胞
消化道出血或下消化道炎症时可出现数量不等的红细胞；白细胞增多可能为肠炎、菌痢和过敏性肠炎等；吞噬细胞可见于急性细菌性痢疾、急性出血性肠炎，偶见于溃疡性肠炎；健康人便中很少见到肠粘膜上皮细胞，增多可见于结肠炎症和伪膜性肠炎。
食物残渣和结晶
脂肪滴及淀粉颗粒属于食物残渣类，正常情况下，食物经充分消化后粪便中极少见到，当消化功能减退、缺乏脂肪酶或胃蛋白酶时，可造成消化不良或吸收障碍，常见于各种原因引起的脂肪泻、腹泻、慢性胰腺炎、肠蠕动功能亢进等。
正常粪便可出现磷酸盐、草酸钙等结晶；病理情况可见夏科-莱登结晶、血红色结晶，主要见于消化道出血、阿米巴痢疾、钩虫病及过敏性肠炎等。
病原学检查
粪便检验是诊断肠道寄生虫感染最直接和最可靠的方法，患寄生虫病时可检测到相应寄生虫体或虫卵。
健康人粪便中极少见真菌，在排除污染的情况下常见于长期使用广谱抗生素、激素、免疫抑制剂、放化疗及各种慢性消耗性疾病。
隐血试验
粪便隐血检查对消化道出血及肿瘤的诊断有重要的价值。消化道恶性肿瘤时，隐血可持续阳性，溃疡病时呈间断阳性。
目前，对消化道肿瘤早期诊断仍缺乏较好的手段，但消化道肿瘤粪便隐血检查阳性率平均为87%，因其简便、价廉、无危害、且经过大规模筛检可及时发现和处理，美国临床生物化学学会（NACB）建议对50岁以上的人群，进行1年1次或2年1次粪便隐血的筛查，可大大提高结直肠癌的检出率。
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