胃肠肿瘤外科以患者的个体化治疗为宗旨，积极推广胃肠肿瘤的规范化手术，重视综合治疗。胃癌的标准D2根治手术、胃手术期综合治疗、胃肠道肿瘤微创手术、胃肠道肿瘤的腹腔镜探查术、胃癌手术中的纳米碳淋巴结示踪技术、早期胃癌的EMR/ESD内镜下治疗、腹腔热灌注化疗及直肠癌的术前放疗等已成为科室特色的常规治疗手段。常规开展治疗胃癌，直肠癌、胃十二指肠穿孔、克隆氏病、肠易激综合征等。